Die Blue Lagoon liegt zwei Seemeilen südöstlich von Agia Napa, wo der Kalksteinfelsvorsprung des Kap Greco in einer Reihe von untergetauchten Terrassen in das Mittelmeer abfällt. Die Wassertiefe übersteigt im viertelkilometerlangen Becken selten sechs Meter, und der weiße Mergelboden reflektiert die Mittagssonne durch die Wassersäule, was den Cyan-Verlauf erzeugt, der dem Ort seinen Namen gibt. Geologen führen die Bildung der Lagune auf karstische Auflösung während des Pleistozäns zurück, als der Meeresspiegel vierzig Meter tiefer lag und Süßwasserbäche Kanäle durch die poröse Koronia-Formation gruben. Als der Ozean anstieg, wurden diese Kanäle überflutet und hinterließen ein Netz aus flachen Buchten und untergetauchten Höhlen entlang der östlichen Flanke des Kaps. Kommerzielle Bootsabfahrten vom Hafen von Agia Napa begannen in den frühen 1990er Jahren, was mit der Erweiterung des Ferienortes als Strandziel am Mittelmeer zusammenfiel. Bis 2010 war die Blue Lagoon der meistbesuchte Offshore-Standort im Bezirk Famagusta geworden, wobei die Betreiber über achtzigtausend Passagierfahrten pro Saison verzeichneten. Das zypriotische Ministerium für Fischerei und Meeresforschung erklärte die umliegenden Gewässer 2018 zur Schutzzone, begrenzte das Ankern auf sandige Flächen und beschränkte die Schiffsgeschwindigkeit innerhalb von fünfhundert Metern vor der Küste. Kap Greco selbst – ein windgepeitschtes Vorgebirge aus Gestrüpp und Kalkstein – wurde 1993 zum Nationalwaldpark erklärt, und seine Meereshöhlen, die nur mit dem Boot erreichbar sind, bleiben eines der charakteristischen geologischen Merkmale der Küste. Die meisten Bootsausflüge zur Blue Lagoon in Agia Napa folgen einer Route im Uhrzeigersinn um das Kap und legen zwischen neun und zehn Uhr morgens ab, um die Lagune vor den Menschenmassen am Mittag zu erreichen. Die Schiffe reichen von Glasfaser-Tageskreuzern mit Platz für dreißig Passagiere bis hin zu Katamaranen mit zwei Rümpfen, die mit Sonnendächern und Badeplattformen ausgestattet sind. Der Standard-Reiseplan beinhaltet einen Badestopp in der Blue Lagoon, einen zweiten Ankerplatz in der Turtle Cove – wo Unechte Karettschildkröten zwischen Juni und August nisten – und eine langsame Fahrt unter den Meereshöhlen, deren gewölbte Innenräume das Geräusch der Brandung verstärken. Einige Betreiber verlängern die Route nach Norden zur Küste von Famagusta und fügen ein Grillmittagessen sowie einen dritten Badestopp in der Nähe von Protaras hinzu. Die Touren kehren am späten Nachmittag in den Hafen von Agia Napa zurück und vervollständigen einen Rundkurs, der etwa zwölf Seemeilen abdeckt und je nach Anzahl der Stopps und Seebedingungen zwischen vier und sechs Stunden dauert.