O Porto de Ayia Napa fica no terminal leste da Avenida 1 de Outubro, onde uma bacia rasa abriga quarenta e três ancoradouros e um cais ativo que atende traineiras de pesca desde a década de 1970. O complexo da marina foi inaugurado em 2012, substituindo um cais estreito de concreto por pontões flutuantes, um posto de abastecimento e uma esplanada pavimentada de pedra ladeada por tamargueiras. O tráfego de embarcações atinge o pico entre maio e outubro, quando o porto processa uma média de duzentas e vinte partidas por semana — lanchas rápidas, catamarãs e iates à vela com destino à Blue Lagoon, às grutas marinhas de Konnos e à reserva marinha de Cabo Greco. O aluguel de barcos em Ayia Napa evoluiu de um punhado de barcos de pesca familiares fretados na década de 1980 para um setor de aluguel baseado em frota, que oferece aluguel de embarcações sem tripulação, cruzeiros diários com capitão e passeios costeiros com várias paradas. A posição do porto na costa sudeste de Chipre oferece acesso direto à península de Kavo Greko, onde falésias calcárias descem vertmente em águas que mantêm visibilidade de vinte e cinco a trinta metros durante os meses de verão. A Turtle Cove, três milhas náuticas a nordeste, continua a ser um local de desova de tartarugas-verdes, e a Blue Lagoon — uma baía rasa entre promontórios rochosos — registra temperaturas de superfície de vinte e seis graus Celsius em agosto. A maioria dos operadores parte entre as oito e as dez da manhã, retornando no meio da tarde para evitar o vento de oeste predominante que se forma depois das duas horas. A frota de aluguel inclui lanchas de convés aberto com motores de popa duplos, catamarãs à vela equipados com toldos de sombra e plataformas de snorkel, e iates a motor de luxo que transportam infláveis e tobogãs gigantes. O aluguel sem tripulação exige uma licença de navegação válida e um depósito de segurança; os cruzeiros com capitão incluem combustível, equipamentos de segurança e planejamento de rota. Os itinerários costeiros normalmente combinam de três a cinco paradas — a Cidade Fantasma de Famagusta vista de águas territoriais, as grutas marinhas no Cabo Greco e paradas para banho em enseadas isoladas acessíveis apenas por água. O serviço de bordo varia de almoços de churrasco preparados em grelhas montadas no convés a travessas de mezze frias e serviço de vinhos locais. O aluguel de barcos em Ayia Napa funciona o ano todo, embora de novembro a março os horários sejam reduzidos e as condições do mar favoreçam rotas abrigadas. O quebra-mar oeste do porto protege a bacia do vento dominante, e o cais de pedra oferece acesso direto de veículos para o carregamento de equipamentos. As operadoras mantêm contato via rádio com a estação da guarda costeira de Larnaca, e todas as embarcações possuem chartplotters GPS, transceptores VHF e coletes salva-vidas classificados de acordo com as normas da UE.